有了皇帝这句“瞧瞧”，利玛窦的北上之路便畅通了。消息传回文渊阁，徐光启心中一定。他知道，真正的博弈，将在利玛窦抵达京城后才开始。他必须在此之前，做好充分准备，将“接纳西学”与“设立专司”巧妙地捆绑在一起，并准备好足以打动皇帝、堵住反对者之口的“利”与“理”。
他再次提笔，这一次，不是写奏章，而是开始起草一份更为详尽、也更具策略性的《请设格致院以纳远学、兴实利疏》的草稿。在草稿中，他将“格致院”的职能定义为：第一，系统整理、研究泰西传入之天文、历算、几何、舆地、火器之学，择其有益者译介试用；第二，统筹国内各地匠作改良事宜，汇集巧匠能人，推广利民良法；第三，培养通晓实学之吏员，以应国用。他刻意淡化了机构的“新异”色彩，而强调其“整理”、“统筹”、“试用”的务实功能，并将其与“怀柔远人”、“增强边备”、“开利源”等皇帝关心的问题紧密挂钩。
同时，他密信江南，催促李之藻和宋应星加快进度，务必在利玛窦抵京前，拿出几项更具说服力的“本土”改良成果，作为“格致”之学并非全盘西化、而是“中西合璧、利在当下”的佐证。
帝国的航船前方，似乎出现了一缕来自遥远西方的微弱星光，与江南工坊里的点点星火交相辉映。徐光启手握舵轮，谨慎地调整着方向，试图将这内外两股新风，汇聚成足以推动这艘古老巨舰转向新航道的合力。然而，平静的海面下，那些习惯了旧航线的暗礁，正冷冷地等待着碰撞的时刻。蓝图虽已初现，但通向“格致院”的道路，注定布满荆棘与考验。
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