柱间遭到泷隐村精英忍者角都的暗杀，柱间以木遁忍术轻松压制角都，并让角都陷入苦战，由于柱间心慈手软，因此放过了角都。 生死之谜 生死之谜 漫画中并没有明确说明柱间的死因，但纲手曾说。柱间与扉间两人都是为了保护村子而牺牲。 其死后大蛇丸和宇智波斑都通过其细胞进行研究，大蛇丸企图使得木遁再现，实验出了大和；宇智波斑则培养出白绝。
此外，志村团藏、宇智波带土、秽土宇智波斑都移植了柱间细胞。 中忍考试 中忍考试篇，与扉间一同被复活 在木叶毁灭行动中，千手柱间与他的弟弟千手扉间一起被大蛇丸以秽土转生的形式复活，他们的意志被完全抹杀，被迫参加战斗，二人无法发挥原本的实力。
在战斗过程中，柱间使用木遁秘术与猿飞日斩展开激烈的战斗，由于两人是秽土身躯拥有不死身，所以只能用封印术，或用武力禁锢他们的动作，于是三代火影使用尸鬼封尽将两位火影的灵魂和大蛇丸的双手一同封印，自己也因此牺牲。
在第四次忍界大战中，大蛇丸获取漩涡一族收纳堂的死神面具，切开腹部释放了被死神吞掉的灵魂，恢复了双手，利用佐助体内的四个白绝分身作为活体祭品，以秽土转生的形式复活了历代火影。
在佐助询问柱间“什么是忍者”、“什么是村子”的问题之后，佐助明白鼬正是继承了火之意志，决定继承哥哥的遗愿，阻止宇智波斑、宇智波带土的月之眼计划。
大蛇丸为了观察佐助、也为了自己的存亡，决定协助佐助。 至此，四位火影正式参战。 忍界大战 柱间奔赴战场后，与其他三位火影联合发动四赤阳阵封住十尾；而此时的十尾释放出一颗尾兽玉，企图破坏结界，柱间已提高警惕做好准备，成功防御了十尾的尾兽玉攻击，使十尾自食苦果。
忍界大战 随后柱间使用木遁木分身变出五个木分身，分别带领着忍者联军前往四赤阳阵结界的四面为忍者联军打开结界的出入口，为给忍者联军留出最佳的攻击时间，柱间使用明神门压制十尾的头部，以便于忍者联军进入结界近距离攻击十尾。
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