档案馆外，战斗已经进入白热化。秦锋的机甲小队与虚空战舰展开殊死搏斗，龙魂机甲的能量刀不断劈开虚空战舰的舰体，但敌人的数量太多，机甲的护盾也开始出现裂痕。凯奇的星航者舰队释放出大量引力弹，在虚空舰队周围形成引力漩涡，暂时阻挡了敌人的进攻，但舰队的损失也在不断增加。
扶苏的秦魂能量源源不断地注入档案馆的屏障，屏障的光芒越来越亮，挡住了虚空战舰的主炮攻击。但幽影的旗舰已经突破了防线，停在档案馆的入口前，舰桥的舱门打开，身披黑色铠甲的幽影悬浮在太空中，铠甲上的虚空能量如同黑色的火焰般燃烧。“渺小的文明，竟敢觊觎万维文明的遗产！”幽影的声音如同金属摩擦般刺耳，他抬起右手，黑色的能量球在掌心凝聚，“今天，我将让你们彻底消失！”
“就是现在！资料传输完成！”莉娜大喊道。铁毅立即发出信号，艾拉首领带领的舰队立即从侧翼发起突袭，绿色的生命能量炮集中攻击幽影旗舰的引擎。幽影被迫中断攻击，转身防御。铁毅抓住机会，与扶苏、莉娜冲出档案馆，登上等候在外的机甲。
“幽影交给我和扶苏，你们负责摧毁虚空战舰！”铁毅的声音传遍整个舰队。他和扶苏的机甲同时升空，龙魂晶与万维水晶的能量融合，形成金红相间的能量气场。幽影看到两人的机甲，眼中闪过一丝不屑：“当年万维文明的执政官都不是我的对手，你们这些小辈也敢挑战我？”
幽影挥手发出一道黑色的能量波，铁毅和扶苏立即驾驶机甲避开，能量波击中旁边的废弃行星，行星瞬间被撕裂成碎片。“他的能量强度是虚空大帝的一半，但速度更快，更灵活。”扶苏提醒道，“注意他的肩部铠甲，那里是弱点。”铁毅点点头，驾驶机甲冲向幽影，镇岳剑带着七彩光芒劈向幽影的头部，吸引他的注意力。扶苏则从侧面迂回，秦魂长枪瞄准幽影的肩部弱点，发起突袭。
幽影果然中计，转身防御铁毅的攻击，却没注意到扶苏的突袭。秦魂长枪精准地刺中幽影的肩部铠甲，红色的秦魂能量瞬间侵入铠甲内部，破坏了能量传输节点。幽影发出一声痛苦的嘶吼，铠甲上的虚空能量开始紊乱，黑色的火焰忽明忽暗。“该死的秦族能量！”幽影愤怒地挥舞能量刃，将扶苏的机甲击退。
铁毅抓住机会，驾驶机甲冲到幽影身后，镇岳剑注入全部的万维能量，劈向幽影的另一个肩部弱点。“噗嗤”一声，铠甲被彻底劈开，虚空能量从伤口处喷涌而出。幽影的身体开始变得透明，他难以置信地看着自己的双手：“不可能！我怎么会输给你们这些小辈！”
“你输的不是实力，是信念。”铁毅的声音通过机甲的通讯器传来，“万维文明守护文明，秦族守护家园，而你只知道掠夺和毁灭。这种信念的差距，注定你会失败。”幽影的眼中闪过一丝不甘，他突然引爆了部分虚空能量，将铁毅和扶苏的机甲震开，转身冲向幽影堡垒：“我不会就这么认输的！虚空维度的意志会继承我的使命，毁灭所有文明！”
“不能让他回到堡垒！”铁毅立即下令舰队全力攻击幽影堡垒的虚空之心。艾拉首领的绿晶族舰队率先开火，生命能量炮连续击中虚空之心的前两层护盾，将其彻底摧毁。铁毅和扶苏的机甲则冲向堡垒的核心区域，将融合后的龙魂晶与万维水晶能量汇聚成一道巨大的能量光束，击中虚空之心的第三层护盾。
护盾瞬间破裂，虚空之心暴露在众人面前。这是一颗黑色的晶体，内部翻滚着狂暴的虚空能量。幽影冲到虚空之心前，想要注入能量修复护盾，却被铁毅和扶苏的能量光束击中背部。幽影喷出黑色的血液，身体倒在虚空之心上，他最后的力量与虚空之心融合，黑色的能量瞬间爆发，将整个幽影堡垒包裹。
“快启动净化装置！”莉娜大喊道。早已准备好的能量净化装置立即启动，金色的净化能量形成巨大的光罩，将幽影堡垒包裹在内。虚空能量与净化能量相互碰撞，发出剧烈的爆炸声。当光芒散去，幽影堡垒已经化为灰烬，虚空之心被净化成一颗纯净的能量晶体，悬浮在星空中。
战斗结束后，舰队在万维遗迹附近休整。铁毅和扶苏走进档案馆，将战争核心数据库的资料全部拷贝。莉娜则在档案馆的深处，发现了一件万维文明的遗留物品——一枚刻有“守护”二字的能量徽章，徽章的能量特征与龙魂晶完全契合。“这是万维文明的‘守护者徽章’，当年凯伦的祖先就是佩戴这枚徽章，与秦族先哲签订盟约的。”莉娜将徽章递给扶苏，“现在，它应该属于你。”
扶苏接过徽章，徽章与龙魂晶产生共鸣，发出柔和的金红色光芒。“秦族的使命，万维文明的遗志，都将由我们传承。”扶苏的眼中充满了坚定。铁毅则走到档案馆的能量屏幕前，将联盟各文明的图腾投影到屏幕上：“万维文明不再是孤独的守护者，现在，多元宇宙的所有文明都站在一起。”
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