随着严党伪造漕运数据的阴谋被彻底揭穿，京城朝堂的风波渐息，但东南沿海的战云却愈发浓重。林远在物流监查司的沙盘前，用红色旗标注出倭寇战船的疑似航线，蓝色旗则标记着隐海船队的布防位置。然而，当苏婉娘将一份密报拍在案头时，他手中的令旗"啪嗒"掉落在地。
"掌柜，漕帮有变。"苏婉娘展开泛黄的信纸，上面的字迹透着焦灼，"自漕运衙门改革后，漕帮内部早已矛盾重重。昔日总舵主因贪污漕银被查办，如今漕帮分裂成扬州、徽州、镇江等六大势力，各自为政。其中扬州漕帮、徽州漕帮与严党余孽暗中勾结，准备在倭寇进犯时封锁运河，截断江南赋税北运的通道。更棘手的是，他们掌控着半数以上的漕船，一旦生变，后果不堪设想。"
林远盯着墙上的《大明漕运图》，目光扫过运河沿岸密密麻麻的漕帮据点。漕帮作为盘踞水路百年的势力，自总舵主倒台后，各分支为争夺利益纷争不断。若不能将其分化，即便有朝廷水军配合，隐海船队与官方水师的内河补给线也将成为致命软肋。
他立刻修书张居正："东南漕运命脉将断，需水师支援！"首辅回信言简意赅："戚继光部已从福建秘密北上，俞大猷部五日前自广东启航，十日可至长江口。"原来，早在隐海船队首航成功时，张居正便与兵部谋划，以"沿海巡防"为名，将两位名将的水师调往东南待命。
三日后，数十份调查报告摆在案头，数据触目惊心：扬州漕帮帮主马如龙垄断了两淮食盐的运输，每年收受严党"保护费"高达二十万两白银；徽州漕帮帮主周鹤年则通过控制丝绸水路，与倭国商人暗中交易违禁品。但并非所有漕帮都甘心为严党卖命，镇江漕帮帮主陈长风成了关键突破口。
烟雨朦胧的金山寺中，林远与陈长风相对而坐。"陈帮主，倭寇进犯在即，严党妄图借漕帮之手截断国之命脉。"林远推过一摞账簿，又展开一张密信，"这是戚继光将军三日前的手书，他的水师已抵达温州港，俞大猷将军的船队也在泉州湾待命。漕帮总舵主因贪腐身败名裂，你若与朝廷合作，既能保住漕帮生计，更可留千古清名。"他压低声音，"此次抗倭，两位将军的水师将与隐海船队互为犄角。但若无漕帮相助，粮草军械恐难及时输送。"
陈长风眉头紧锁："林大人，我等漕帮讨生活不易。扬州那帮人背靠严党，又有倭寇撑腰......"话音未落，林远取出一份文书："这是皇上御批的《漕运商户自治条例》，只要漕帮协助朝廷运输军需物资，可获得官府保价护航、优先使用码头等特权。此外，水师衙门承诺，战时将派战船护送漕运船队。"
权衡再三，陈长风终于点头："我愿说服太湖漕帮、九江漕帮倒戈。但要让漕帮彻底决裂，需断了严党的财路。"林远早有准备，他召来算术弟子，当场算出惊人数据："若整合倒戈漕帮的运力，再配合隐海船队开辟海运支线，可将江南至京城的运输成本降低四成。严党许诺的利益，在实打实的银钱面前不值一提。"
分化行动悄然展开。暗影小组化身商贾，在漕帮聚集的码头散布消息："听说镇江漕帮接了朝廷的皇差，每石粮食运费比市价高两成。戚继光将军的水师已到崇明岛，扬州漕帮私通倭寇，怕是要完！"与此同时，林远安排物流学堂的工匠，为倒戈漕帮的船只加装防撞铁板、改良船帆，提升其在复杂水情下的运输能力。水师衙门也暗中派出小股战船，在漕帮控制水域巡逻，威慑严党势力。
严党很快察觉异动。扬州漕帮帮主马如龙亲自带队，率领百艘漕船封锁运河咽喉瓜洲渡口，扬言道："谁敢与朝廷合作，就是与整个漕帮为敌！"此时，陈长风率五十艘战船突然现身，船头高悬"奉旨护漕"的杏黄旗。更令马如龙震惊的是，原本与他结盟的徽州漕帮，竟带着商船转向镇江船队。
"马帮主，严党大势已去。"陈长风立于船头，手持万历皇帝的敕令，"漕帮总舵主因贪腐身败名裂，你如今私通倭寇、阻塞漕运，戚继光将军的水师已过江阴，俞大猷将军的船队也快到狼山！"马如龙恼羞成怒，下令开船冲撞，却发现对方船只坚固异常，自己的船桨撞上铁板竟当场折断。
就在双方对峙时，苏婉娘率隐海船队从长江口疾驰而来，远处传来隆隆炮声——俞大猷将军的广东水师已封锁入海口，戚继光的福建水师战船也出现在瓜洲渡口上游。改良后的福船船速极快，瞬间形成包围之势。马如龙见势不妙，妄图逃窜，却被暗影小组提前布置的铁链网缠住船舵，更被水师火炮的轰鸣声彻底震慑。当他被押解上岸时，怀中掉落的密信暴露了严党最后的阴谋：计划在海战正酣时，炸毁运河关键闸口，让江南彻底成为孤岛。
这场漕帮争夺战的胜利，不仅确保了运河航道的畅通，更与朝廷水师形成完美配合。林远立即启动应急预案，安排工部工匠加固闸口，同时在沿岸布防。当倭寇战船如期进犯时，倒戈的漕帮船只满载粮草穿梭于内河，隐海船队与戚继光、俞大猷的水师在海上形成钳形攻势。严党精心布局的"内河封锁线"，在分化瓦解与水陆协同的雷霆攻势下土崩瓦解。
战后论功，陈长风被封为"漕运协理使"，获许组建官方漕运船队。其余倒戈漕帮也得到朝廷庇护，得以光明正大地参与物资运输。林远借此机会推行《漕运商规二十条》，将漕帮纳入官方监管体系，规定船只建造标准、运费上限，并设立"漕运仲裁司"调解纠纷。漕帮自总舵主倒台后的分裂局面，也在新的秩序下逐渐走向规范。
站在焕然一新的漕运码头，林远望着往来如织的商船，深知这场胜利意义深远。漕帮的倒戈与朝廷水师的配合，不仅斩断了严党在地方的经济爪牙，更在东南沿海构筑起一道坚实的立体防线。但他并未放松警惕——暗影小组传来消息，胡文远残部已逃往南洋，正与葡萄牙商人密谋更大的阴谋。暮色中，林远握紧腰间令牌，新一轮的博弈，已然拉开帷幕。
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