两省百姓为了疫情做出了巨大的牺牲，而朝廷自然也是尽力的去挽救和弥补自己的过错。
除了两年的抗疫时期，无数的物资和药草被无偿的运送至了两省各地。朝廷更是下旨免除了两省未来五年的所有赋税。
除此之外，为了集合更多的物资运用到两省。加上征东大将军、安远伯戚金的病逝，朝廷无奈暂停了在日本的征伐，将兵力收缩至了近畿与中部一线，此举也给了德川幕府一个喘息的机会，为后面的不利战事埋下了伏笔。
除此之外，西北的满桂也停下了征服伊犁平原的脚步，喀尔喀蒙古的明军也停住了脚步，随后，满桂和卢象升两人便被调回京师述职。
可以说，十年来明朝咄咄逼人的军势被这波疫情给极大的遏制住了。同样，也给了如今大明周边所有敌人一个喘息的机会，特别是失去了天皇这个最佳挡箭牌的德川幕府。
天启十四年（1634年）明正天皇被俘，与其同时被俘的还有整个天皇家族。
历史可追溯至公元前660年的神武天皇至如今被俘的明正天皇，两千二百余年的国祚，彻底在朱由校的手中被断绝。自此，日本再也没有了天皇的称谓。
为了表彰征东大军的功绩，病逝于前线的安远伯戚金被明廷追封为了定远武王。其长子戚元功晋丰为了世袭罔替的定远侯。
回京就任阁臣的孙传庭被敕封为振武伯；新宁伯潭弘业晋升崇安侯；忠贞伯秦良玉晋升忠贞侯。
随着戚金的病逝，孙传庭的回国述职，秦良玉被朱由校册封为了新任的征东大将军，马世龙、尤世功、祖大寿三人被晋升为中将，并有三人分别组建了第一集团军、第二集团军、第三集团军。九州第一集团军改编为了第四集团军，四国第二集团军改编为了第五集团军，长州第三集团军改编为了第六集团军。
在抽调回国十个近卫师之后，在日的明军以及仆从军兵力还是达到了五十六万之巨。
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