吕隆在吕超的苦苦劝说下，最终听从了他的建议，派遣使者请求投降。姚硕德上书后秦国主姚兴，封吕隆为使持节、镇西大将军、凉州刺史、建康公。之后，吕隆遣送同母的弟弟、自己的儿子、大臣慕容筑、杨颖、史难、阎松等五十多口人到长安作人质，姚硕德这才退兵。
再启战端，穷途末路终亡国
后秦军队撤退后，吕隆本应休养生息，整顿内政，以图恢复国力。然而，他却不甘心就此沉沦，又一次做出了错误的决策。他派吕超进攻在晏然（今甘肃武威市西北）的姜纪。姜纪原是后凉将领，秃发利鹿孤攻姑臧时，投降了南凉，在焦朗引姚硕德攻姑臧时他转而投秦，被姚硕德举为武威太守，配兵二千屯驻晏然。吕超攻姜纪，只以伐叛泄恨为目的，结果反被姜纪打败。
失败后的吕超仍不甘心，又调头进攻占据魏安（今甘肃武威东南）的焦朗。焦朗见势不妙，遣其弟子焦嵩为质于河西王秃发利鹿孤求援。秃发利鹿孤派遣车骑将军秃发傉檀前往援助。吕超闻焦朗引南凉为援，不敢再攻，便退回姑臧。
秃发傉檀却并未就此罢休，他再次深入武威郡。吕超得知秃发傉檀已在胡坑扎营，企图夜袭，然而秃发傉檀早有预料。当夜，吕超的中垒将军王集率精兵二千袭击南凉军营，结果大败而归。吕隆见此情形，深知自己已无力与秃发傉檀交锋，心中充满了恐惧和绝望。
公元402年二月，沮渠蒙逊带兵进攻姑臧。吕隆派遣使者向河西王秃发利鹿孤求救，秃发利鹿孤命令广武公傉檀率领骑兵一万前往支援。还没等秃发傉檀赶到，吕隆便将沮渠蒙逊击败。沮渠蒙逊请求与吕隆讲和，并留下一万多斛谷物救济饥民，随后返还。
然而，这短暂的胜利并没有改变后凉的命运。公元402年十月，南凉景王秃发傉檀再次攻打姑臧。公元403年，由于频繁地遭到秃发傉檀和沮渠蒙逊的攻打，吕隆深知后凉已无力抵抗，后凉的灭亡只是时间问题。无奈之下，他只得命令吕超率领二百骑兵，带了很多珍贵的宝物，前去请求姚兴来接他。
姚兴派遣他的部将齐难等步、骑兵四万来迎接。齐难到达姑臧后，吕隆乘坐素车，驾着白马在道旁迎接，尽显落魄与无奈。他派吕胤去吕光庙祷告，吕胤追溯吕氏往日功绩并联系今日窘迫的形势，不禁悲从中来，哀痛告别。吕隆率领一万多户，跟随齐难到达长安，后凉至此正式灭亡。
寄人篱下，谋反被诛终落幕
吕隆投降后秦后，被姚兴任命为散骑常侍，公爵爵位照旧，弟弟吕超被任命为安定太守。虽然表面上他仍享有一定的地位和待遇，但实际上却只是一个寄人篱下的傀儡，处处受到姚兴的监视和控制。
在后秦的日子里，吕隆的心中始终充满了不甘和屈辱。他怀念着曾经在后凉的权力和地位，渴望有一天能够东山再起，恢复吕氏的荣耀。于是，他暗中积蓄力量，与儿子吕弼密谋反叛。
然而，他们的计划却被姚兴提前得知。公元416年，姚兴迅速派兵镇压了叛乱。吕隆和吕弼在这场叛乱中被诛杀，他们的梦想也随之彻底破灭。吕隆的一生，就这样在权力的挣扎与欲望的驱使下，画上了一个悲惨的句号。
吕隆死后，并没有得到一个正式的谥号，后世多称其为“后主”，以表示他作为后凉末代君主的身份。他的一生，是充满悲剧色彩的一生。他在错误的时间登上了皇位，采取了错误的统治手段，最终导致了后凉的灭亡和自己的身死。他的故事，成为了十六国时期权力斗争和王朝兴衰的一个生动写照，也让后人深刻地认识到了在那个动荡不安的时代，作为一名君主所面临的巨大挑战和抉择。
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