最终，炭治郎在祢豆子的帮助下醒来，并解除了魇梦的血鬼术。随后，魇梦为了阻止向自己赶来的炭治郎，因而对其制造出了被死去的亲人指责的噩梦，但均被炭治郎化解。而炭治郎反而因为家人被侮辱而愤怒到了极点，便立马冲到车顶找到了魇梦，并将其一刀斩首。然而，由于魇梦的本体已经和火车合体，因而其并未死亡。随后，伊之助和杏寿郎依次醒来，并前来助阵。炭治郎在火车车头找到了魇梦的本体，并以火之神神乐·碧罗天斩断了魇梦本体的脊椎，成功将其消灭。
在消灭魇梦后，上弦之叁·猗窝座突然降临，轻松地将炭治郎等人击倒。而杏寿郎则为了保护炭治郎等人，因而奋不顾身地与猗窝座交战。最终，杏寿郎在燃尽生命使出了炎之呼吸奥义·九之型·炼狱，但被猗窝座以破坏杀·灭式化解后，在同猗窝座的肉搏中被其贯穿了胸膛，但也仍然坚持钳制住了其双臂，打算拖到天明与其同归于尽。因为黎明将至，猗窝座不得已自断双臂狼狈逃走。但在其逃走时，炭治郎将自己的日轮刀投出，刺穿了猗窝座的身体，并怒斥猗窝座不过是只是个只敢在黑夜中战斗的胆小鬼。
炭治郎和杏寿郎
在临终之前，杏寿郎告诉炭治郎自己的故乡可能有着关于火之神神乐的消息，并将自己想对父亲和弟弟说的话告诉了炭治郎。在将意志托付给了炭治郎等人后，杏寿郎就笑着死去了。除了杏寿郎本人外，包括炭治郎等人在内的全列车两百多名乘客无一身亡。因为杏寿郎的战死，炭治郎对于自己的弱小非常自责。
不久后，在前往炼狱家送杏寿郎的讣闻时，杏寿郎的父亲——炼狱家家主炼狱槙寿郎在看到了炭治郎的日轮耳饰后勃然大怒，并出拳痛殴炭治郎，同时指出炭治郎就是起始呼吸·日之呼吸的使用者，直到被炭治郎用头槌反击后才清醒了过来。在造访杏寿郎的弟弟千寿郎后，炭治郎下定决心要变强，但随即又因为弄丢日轮刀而再次被钢铁冢萤追杀了一天一夜。
后来，炭治郎收到了槙寿郎寄来的道歉信，并从中得知了有关日之呼吸和自己额头上的斑纹的信息。但炭治郎因为自己的斑纹不是天生的，因此并不认为自己是所谓的“被选中的起始呼吸使用者”，但也同时表示即便如此自己也不会退缩。
自炼狱家归来过了几个月后，在音柱·宇髄天元前来蝶屋抓女孩子时，炭治郎因为音柱将女孩子当成东西乱扔而感到愤怒，并表示：“人人都有自己的苦衷，不要仗着自己阶级高就肆意践踏他人的尊严。”主动向其表示自愿代替神崎葵前去，伊之助与善逸也表示愿意同往，于是三人跟着天元前去吉原执行任务。
之后，炭治郎被天元变装成了游女“炭子”，并卧底在吉原着名的青楼“时任屋”。之后，因为发现上弦之陆·堕姬意图抓走时任屋的明星花魁鲤夏，而与她交战。在交战过程中，被对方嘲讽刀才攻击没几次就出现裂痕，因而深觉自己不适合使用水之呼吸。因为堕姬不讲道理，即使夺走他人生命也不会反省后悔的蛮横言行，愤怒的炭治郎随即便开始使用火之神神乐持续对堕姬发动猛攻。
然而在只差一步就能够打倒堕姬时，炭治郎的身体能力却达到了极限，并险些因此丧命。此时，妹妹花子的灵魂及时出现，并请求哥哥赶紧停下来，炭治郎这才保住了性命，但也因体力不支而晕倒。随后，愤怒的祢豆子代替哥哥上阵，却因为被怒火冲昏了头脑而急剧鬼化，完全压制了堕姬。接着，炭治郎再次被弟弟竹雄的灵魂唤醒，出面阻止了差点要变成食人恶鬼的祢豆子，并为她唱了她小时候最喜欢的摇篮曲而将她哄睡着。而堕姬也被随后赶到的宇髓天元斩首。
但堕姬在被斩首之后并未死亡，而是出于委屈和羞耻而大声哭泣，并召唤出了其兄长——上弦之陆·妓夫太郎。在与堕姬和妓夫太郎的交战中，炭治郎一开始使用混合呼吸救下了天元的妻子雏鹤。然而，在妓夫太郎的强大攻势下，众人逐渐倒下。之后，在炭治郎醒来时，妓夫太郎大声嘲笑了没能好好保护自己的妹妹的炭治郎，并询问炭治郎是否愿意变成鬼。但发火的炭治郎却趁机对其使出了头槌攻击，将雏鹤发射出的苦无刺在了他的腿上。随后，妓夫太郎因苦无上涂有的藤花毒而暂时失去了行动力，炭治郎便趁机试图直接斩首妓夫太郎，同时善逸和伊之助也站起身来联手攻击堕姬，打算将二鬼一同斩杀，但因为藤花毒失效，妓夫太郎逐渐恢复了行动力而失败。
接着，宇髓天元在重新赶来之后，以完成的谱面压制了妓夫太郎，而炭治郎在意图斩杀妓夫太郎时，被其用圆斩旋回刺中了下巴而中毒。但与此同时，炭治郎在陷入绝境之际觉醒了斑纹，因而大幅提升了力量。最终，在炭治郎、善逸和伊之助的合力攻击下，堕姬与妓夫太郎的头颅同时被砍落。然而，吉原一带随即就被从妓夫太郎体内出现的巨型螺旋血刃化为了废墟。最后，经由祢豆子的血鬼术，炭治郎、天元和伊之助体内的血镰毒素都被成功清除。
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