“牧公日理万机，学生实在是叨扰了。”
方以智虽然名头再大，但对方毕竟是内阁辅臣，当朝宰执，他也不敢倨傲，只是执晚辈礼拜访。
堵胤锡出身寒微，而且也不是那种天之骄子的科场俊杰，比方以智大了十几岁的他也就比对方早一届进士而已，名次也不高，若是换做太平时节，大概最后就是在地方上当个参政之类限制致仕，但时势造英雄，板荡之下，原本只能在府县基层打转的他，却走到了那些个名士大儒望尘莫及的位置。
“密之不必多礼，我知道你是想来问些什么的。”
“这次陛下召你为翰林学士，应是好事，之前肇庆之时，国家危难，也一直没有什么翰林院之说。密之家学渊源，才名彪炳，陛下大概也是存了千金买马骨的意思。你在崇祯之时不就是翰林侍读学士嘛，如今官复原职，还有所提携，有什么好惶恐的。”
不同于之前聚集在肇庆拥立朱由榔的这帮两广官僚，方以智那是正儿八经的进士及第，选庶吉士，内阁预备军，若非甲申国难，恐怕要不了几年，就成“方阁老”了。
只可惜，朱由榔的出现，打破了过去“非翰林不得入阁”的政治门槛，毕竟当年拥立朱由榔的，就是这些科举竞争的失败者，被打发到两广府县的官吏。
科举之前，朱由榔以内阁名义征辟了一批旧有官吏和士子进入朝廷，以补缺人手不足。
方以智是三天前接到了征召的圣旨，内阁改制后，对于官员任免的诏命重新规范，从理论上来说，没了司礼监以后，内阁是可以直接自行决议，向下面的单位发号施令。
但朱由榔的威望摆在那儿，即使他一句话也不说，所有人也不能忽视他的意见，天子御笔签发，依旧是圣旨合法性的必要步骤。
于是，大明的圣旨体制又回到了“唐宋旧制”，天子旨意必须经由内阁盖章，才算是正儿八经的制诏，否则，只能算中旨。
事实上，对于制约皇权这件事情，朱元璋在废除宰相之后，却依旧保留了六科封驳之权，从制度上，如果从内阁到六科的官员誓死不从，皇帝的诏书就没有意义。
但中期以后，天子们开始利用太监钳制文官，而后直接绕过内阁、六科，下达中旨，所谓“封驳审议”，形同虚设。
于是乎，文官既然在制度上无法限制皇帝，那就干脆摆烂，通过扯皮和对喷来拖延挣扎，皇帝也只能靠不断加强宦官权柄，监督执行。
朱由榔既然立下了规矩，就得自行遵守，纵使他如果真的绕开内阁，直接下旨，一样无人敢质疑，但规矩就是规矩，自己都带头践踏，就无法用以约束他人，所以朱由榔凡有意旨，都要征询内阁决议，当然，内阁不敢不同意罢了。
方以智抵达南京后，从其他旧友关系中得知，如今天子重建后的翰林院，似乎与原本翰林大不相同，故而上任之前，再加之这些天，皇帝的种种操作，心中揣揣，却是先来拜访堵胤锡。
“牧公，可我听说，陛下却是废了翰林当中许多机构，而是设立了些什么......物理所，可有此事啊？”
前日他和一名老友聚会，那人酒桌之上就抱怨过。
说陛下为奸人所蛊惑，好好地翰林院文华之地，不去专心修订校对典章制度，而是要搞个什么物理研究所、化学研究所，实在有辱斯文，甚至有原本被征用的士子，知道情况后主动辞职挂印而去。
这让方以智大为疑惑
堵胤锡笑着捋了捋长须，让自家儿子给二人斟茶，缓缓问道
“我听说密之你以前和崇祯时钦天监的汤若望走得比较近？”
“确有此事，汤先生格物学问了得，学生和他多有交际。”
堵胤锡颔首
“这边是缘故所在了，之前陛下点名要你来做这个翰林学士，我还觉得奇怪，后来打听了一下，我估计就是这个缘由，密之你对格物之学也有所钻研吧？”
这倒是朱由榔自己对历史记得不清楚，这时候的方以智，由于受战乱影响，还没写完《物理小识》，他在科学上的成就总结，主要集中于晚年。
其实所谓“物理小识”和真正的物理学关系不大，更类似于一种自然哲学，缺乏引入真正的数理体系，伽利略的科学方法与笛卡尔的数学体系，才是近代物理学不同于自然哲学的关键。
好在此时也并不晚，至少笛卡尔都还在世。
通过与利玛窦、徐光启等人的思想碰撞，方以智本人的科学观已经走到了时代前列，比如他所着的《东西均》里，就已经把现有学术体系分为“质测”（自然科学）、“宰理”（社会科学）和“道几”（哲学）三大类，突破了两宋以来的儒家理学统治边界，重新探讨认识世界的问题。
朱由榔在后世是工科生，虽然具体知识大多被忘到了犄角旮旯，但他起码知道，所谓科学、技术，是两码事，想要在技术上取得长足突破，就必须要建立一个基础学科研究体系。
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