在稍微夸赞几句后，朱由检提出了自己的问题。
他现在非常期待方以智提出的解决方案能与自己高度契合，那样的话，自己的计划就会增添更强的主动力。
“启奏圣上，臣以为，我皇明若想不被赶超，那就当学其重视实用人才之培养方法。
臣建议设立专门学堂直至大学，从幼童少年中发掘并培育人才，教授其数学等相关知识，多多与欧洲相关方面进行合作交流，并将其定为长期之策，不因一时之成败而止步不前。
长此以往，我皇明焉有不强之理！”
方以智从容施礼后给出了自己的答案。
“甚好！
卿可愿意担此重任？”
方以智的回答让朱由检非常满意，这与他创立皇家理工学院的思路完全一致。
“若能遂君王之志，臣愿用毕生投入于此！”
方以智躬身慨然道。
“好！
方卿可能不知，朕已创立皇家理工学院，其目的与卿别无二致！
既是卿愿意为国育才，那学院祭酒之位便是卿的！”
方以智、郑芝凤陛见数日之后，圣旨发出。
方以智以礼部尚书衔出任皇家理工学院祭酒。
鸿胪寺卿李进番调任礼部左侍郎一职，其职位由郑芝凤以礼部侍郎衔接任。
与此同时，鸿胪寺升格为正三品衙门，署衙所需人才以及职官升擢，由吏部及鸿胪寺堂官议定。
出访欧洲使团成员中病殁者入英烈祠祭祀，有亲属者领烧埋银五百两；使团官吏均升两级，担任使团护卫的锦衣校尉同例。
选派留学的孤儿都进入理工学院继续学习，照顾他们的护从全部转为学院吏员，俸禄照其他衙门人员例发放。
方以智、郑芝凤的正妻均获五品宜人封赠，其余人等每人赏银一百两。
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