这时的安丘侯张步带着妻儿逃往了临淮，与弟弟张弘、张蓝企图召集旧部，乘船入海。琅邪太守陈俊率军追击讨伐，并将其斩杀。
本年十一月，杨广去世了，隗嚣顿时就陷入了困境，他的大将王捷驻守在戎丘，登上城墙就向汉军呼喊：“为隗王守城的人，都抱有必死之心，绝无二心。请你们退兵，我愿以死明志。”于是就自刎死了。
想当初，刘秀曾告诫吴汉说：“各郡的士兵只会消耗粮食，若是有逃亡的事情发生，就会动摇军心，应当把他们全部遣散。”吴汉等人想要集中兵力攻打隗嚣，就没有及时遣散士兵，导致粮食日渐减少，士兵们也变得疲惫不堪，开始逃亡的人就越来越多了。岑彭则是堵住谷水灌淹西城，城墙只剩下一丈多未被淹没。这时恰逢王元、行巡、周宗率领蜀地五千多援军从高处突然赶到，他们就鼓噪大呼：“百万大军到了！”汉军大吃一惊，还没有列阵，王元等人就已经冲破了包围圈，他们拼死奋战，终于进入了城中，将隗嚣接回了冀县。此时，吴汉的军队因为粮草耗尽，就焚烧辎重，然后率军撤下了陇山，盖延、耿弇也相继撤退。隗嚣看到汉军撤退了，就派兵尾随追击各营，这次又是岑彭负责断后，众将才得以全军东归；只有祭遵驻守在汧县，没有撤退。随后，吴汉等人就再次驻守在长安，岑彭则是返回了津乡。汉军撤退之后，安定、北地、天水、陇西等地又反叛归附了隗嚣。校尉太原人温序被隗嚣的将领苟宇俘获，苟宇多次劝降。温序大怒，就呵斥苟宇等人说：“你们这些贼子怎敢胁迫汉将！”随即就用符节击杀了数人。苟宇的部下争相要杀了温序，苟宇制止道：“这是义士，愿为气节而死，可以赐他剑。”温序接过剑后，就把胡须衔在口中，对左右说：“如今既然被贼寇所杀，就不要让胡须沾污泥土了！”于是就自刎而死。从事王忠将他的遗体送回了洛阳，刘秀就下诏赐予他墓地，又任命他的三个儿子为郎官。
十二月，高句丽王派使者前来朝贡，刘秀就恢复了他的王号。
这一年，发生了大水灾，死了好多人。
公元33年的春季，正月，颍阳成侯祭遵在军中去世。随后，刘秀就下诏命令冯异兼领他的部队。祭遵为人廉洁节俭，谨慎小心，克己奉公，他会把朝廷给他的赏赐全部分给士兵；他管理的军队军纪严明，所到之处百姓都不知道有军队驻扎过。他选拔人才就用儒家的那套标准考核。平时喝酒娱乐，也都是唱唱正经的雅诗，玩玩投壶游戏而已。他临死前，还交代家人办丧事要从简。别人问他家事，他也始终不说话。祭遵死后，刘秀特别伤心。祭遵的灵柩运到河南时，刘秀就穿着白色丧服亲自去悼念，远远看见灵车就痛哭流涕。回宫的路上，经过城门，看到灵车又忍不住哭。他的丧礼办完后，刘秀还亲自用最高规格的太牢之礼去祭祀。还下诏书安排大长秋、谒者、河南尹操办丧事，大司农则是负责出钱。到下葬的时候，刘秀又跑去现场悼念，等下葬完还到祭遵坟前，慰问他的老婆孩子。后来上朝时，刘秀就经常感慨：“我要上哪再找像祭征虏（祭遵）这么一心为国、大公无私的人啊！”卫尉铫期就说：“陛下对祭遵已经仁至义尽了，现在这么一直念叨，大臣们都觉得又惭愧又害怕。”听他这么一说，刘秀才不再提了。
另一边，隗嚣混得很惨，又是生病又是挨饿的，只能啃干粮充饥，最后就这么憋屈的死了。隗嚣死后，王元、周宗就拥立隗嚣的小儿子隗纯当王，然后带着军队守在冀县。就在这时，公孙述派赵匡、田弇去支援隗纯，刘秀也派冯异去攻打他们。
公孙述还派了翼江王田戎、大司徒任满、南郡太守程泛，带着几万人顺着长江往下游打，最后打败了冯骏的军队，占领了巫县、夷道、夷陵，接着又拿下了荆门、虎牙地区。他们在长江上搭浮桥、建关楼，打木桩拦住江面，又在山上扎营，把陆路也封死了，这一系列操作就是为了拦住汉军，不让他们过来。
夏季六月，刘秀巡幸缑氏，最后登上了轘辕山。
吴汉带着王常等四位将军，领着五万多士兵，在高柳这个地方攻打卢芳的手下贾览和闵堪。结果匈奴派兵来帮忙，最终汉军打了败仗。从这以后，匈奴就越来越嚣张了，三天两头的跑过来抢劫。刘秀没办法，只能安排朱祜驻守常山，王常驻守涿郡，破奸将军侯进驻守渔阳，还让讨虏将军王霸担任上谷太守，专门防备匈奴。
到了后来，刘秀就派来歙掌管各路将领的军事，驻守在长安，还让太中大夫马援给他当助手。来歙跟刘秀说：“如今的公孙述靠着陇西、天水这两块地方硬撑着，现在这俩地方被咱们打下来了，公孙述也没啥招儿了。咱们得赶紧增兵，多储备粮草。现在西州刚平定，老百姓和士兵肯定又累又饿，要是给点粮食和钱财，就能把那些人都招揽过来。我知道现在国家花钱的地方多，手头紧，但这事儿不办不行啊！”刘秀觉得有道理，就同意了，还下令在汧县存了六万斛粮食。到了秋天八月，来歙就带着冯异等五位将军，又跑到天水去打隗纯。这边骠骑将军杜茂在繁畤和贾览打了一仗，结果杜茂被打得很惨。
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